Die Bundesakademie für Sicherheitspolitik steht im ständigen Austausch mit Partnern im In- und Ausland, um den Gedanken der vernetzten Sicherheit mit Leben zu füllen.
Da die BAKS bewusst keinen eigenen Lehrkörper hat, ist sie auf die aktive Zusammenarbeit mit zahlreichen Organisationen und Einrichtungen angewiesen. Deren Fachleute garantieren mit ihrer Expertise sowohl die hohe Qualität der Lehre, als auch die Aktualität der Inhalte.
Nationale Partner der BAKS sind unter anderem die Stiftung Wissenschaft und Politik (SWP), die Deutsche Gesellschaft für Auswärtige Politik (DGAP) und die Münchner Sicherheitskonferenz sowie politische Stiftungen.
Auf internationaler Ebene nimmt die Bundesakademie für Sicherheitspolitik eine aktive Rolle im Zusammenschluss des European Security and Defence College ein. Sie unterhält aber auch individuelle Partnerschaften mit internationalen Einrichtungen, die sich ebenfalls einem umfassenden Verständnis von Sicherheitspolitik verschrieben haben, zum Beispiel
das „Institut des Hautes Études de Défense Nationale“ in Frankreich,
das „Geneva Centre for Security Policy“in der Schweiz,
und das „Biuro Bezpieczeństwa Narodowego“in Polen.
Mit ihren internationalen Partnern veranstaltet die BAKS gemeinsame Foren, Konferenzen oder Vorträge. Auch die Organisationen der Ehemaligen stehen in Verbindung und erweitern das Netzwerk der „Strategic Community“ international.